More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2441 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  746    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  51.97 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  51.55 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  46.46 
 
 		 356 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  45.98 
 
 		 365 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  44.83 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  45.4 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  36.92 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  34.12 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  33.7 
 
 		 400 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  36.17 
 
 		 373 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  33.62 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  33.03 
 
 		 404 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  34.18 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  33.7 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  30.32 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  30.46 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  30.75 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  27.55 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  29.75 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  37.24 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 356 aa  123  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 359 aa  122  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  34.47 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  33.19 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.86 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.79 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.57 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  29.21 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  27.54 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 326 aa  99.4  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  27.78 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 356 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  24.08 
 
 		 381 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.29 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 370 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  30.38 
 
 		 339 aa  93.6  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  27.14 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  24.8 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  35.74 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 338 aa  89.4  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  30.94 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  36.09 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  26.1 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  26.61 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.65 
 
 		 359 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  25.21 
 
 		 358 aa  86.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  30.43 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>