More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0551 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 338 aa  704    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  62.39 
 
 		 341 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  41.62 
 
 		 342 aa  285  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  31.4 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.96 
 
 		 331 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  30.23 
 
 		 363 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  27.41 
 
 		 370 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 357 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 347 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 387 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 		 356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 375 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  24.9 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  27.34 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  22.54 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  23.36 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24.49 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  23.65 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 		 373 aa  96.3  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 348 aa  95.9  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  23.74 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  26.15 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  25.31 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 367 aa  92.8  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  23.35 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  22.34 
 
 		 357 aa  92.8  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  24.41 
 
 		 404 aa  92.8  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 350 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  25.31 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  21.39 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.09 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.28 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.74 
 
 		 366 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.69 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 400 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  23.69 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  24.41 
 
 		 369 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 351 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.69 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.69 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 369 aa  85.9  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.69 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.69 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  22.59 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.31 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>