More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5766 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
353 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  65.71 
 
 
355 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  65.12 
 
 
352 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  63.19 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  59.08 
 
 
367 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  56.4 
 
 
354 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  47.34 
 
 
345 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  45.82 
 
 
350 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  47.54 
 
 
355 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  44.93 
 
 
353 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  42.9 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  42.18 
 
 
350 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  43.07 
 
 
350 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  41.59 
 
 
350 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  41.59 
 
 
350 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  45.68 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  43.95 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  43.66 
 
 
368 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  42.18 
 
 
352 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  41.11 
 
 
358 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  32.03 
 
 
390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  31.19 
 
 
398 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  32.67 
 
 
374 aa  176  8e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 
347 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
337 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
335 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  26.54 
 
 
345 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 
341 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  28.98 
 
 
370 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 
338 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.4 
 
 
353 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.75 
 
 
331 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 
361 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  31.73 
 
 
333 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.27 
 
 
313 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
347 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.32 
 
 
363 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 
352 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  26.83 
 
 
337 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 
387 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  22 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  26.37 
 
 
328 aa  94  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
375 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.79 
 
 
339 aa  92.8  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.87 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 
329 aa  89.4  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
344 aa  89.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.77 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  24.78 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  21.96 
 
 
359 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 
412 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 
311 aa  86.3  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.55 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.09 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  34.2 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.55 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  24.5 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.81 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  23.82 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  37.59 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 
400 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.56 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  29.18 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  25.71 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  26.07 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  36.8 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.44 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  24.49 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  36.49 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>