More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1468 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
316 aa  635    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  35.71 
 
 
345 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 
337 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  31.25 
 
 
328 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  32.6 
 
 
333 aa  153  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  27.3 
 
 
332 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  26.17 
 
 
326 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  32.87 
 
 
300 aa  132  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0379  hypothetical protein  29.15 
 
 
301 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  27.94 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  24.44 
 
 
296 aa  114  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  26.45 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  21.23 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0600  oxidoreductase-like  23.47 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.476523  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  29.84 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.43 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  28.72 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.28 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  27.78 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  28.1 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 
412 aa  75.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.83 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  24.92 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  26.89 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.21 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  27.63 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.05 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  22.48 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  28.75 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  29.96 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  26.85 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  24.41 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  32.54 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  28.82 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.07 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  25.32 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.15 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  24.23 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.4 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  24.47 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  23 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  23.67 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  26.93 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  28.07 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  28.7 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  21.19 
 
 
357 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  23.11 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  23.11 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>