More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4435 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
352 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  68.12 
 
 
355 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  66.57 
 
 
372 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  65.12 
 
 
353 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  57.06 
 
 
354 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  50.15 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  44.05 
 
 
345 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  44.64 
 
 
355 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  47.37 
 
 
347 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  43.86 
 
 
350 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  47.16 
 
 
368 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  42.73 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  43.57 
 
 
350 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  43.93 
 
 
358 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  43.27 
 
 
350 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  43.57 
 
 
350 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  41.74 
 
 
353 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  42.36 
 
 
352 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  38.37 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  41.88 
 
 
345 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  30.08 
 
 
390 aa  179  7e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  29.4 
 
 
398 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  30.96 
 
 
374 aa  159  8e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  34.73 
 
 
333 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
347 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  31.17 
 
 
353 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 
356 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
335 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
345 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
353 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 
361 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
341 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  24.18 
 
 
345 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 
344 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  23.36 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 
349 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  28.98 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  21.94 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.25 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.22 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  31.17 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.51 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  27.15 
 
 
344 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 
342 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  35.15 
 
 
330 aa  89.7  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.7 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  31.28 
 
 
324 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 
324 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.89 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 
334 aa  89.4  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 
412 aa  89.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 
375 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  24.85 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  22.87 
 
 
310 aa  87  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 
387 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
387 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  21.68 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  26.07 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  34.36 
 
 
669 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  34.25 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  23.67 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.2 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.36 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  34.43 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  23.28 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  28.16 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  24.41 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  26.46 
 
 
388 aa  79.3  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  22.69 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  21.45 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
335 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  22.69 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>