More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2602 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 350 aa  709    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  98.57 
 
 		 350 aa  699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  95.14 
 
 		 350 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  89.11 
 
 		 350 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  78.9 
 
 		 352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  71.63 
 
 		 347 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  50.88 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  47.79 
 
 		 355 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  48.21 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  42.6 
 
 		 345 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  47.17 
 
 		 345 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  46.02 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  43.43 
 
 		 357 aa  298  7e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  44.51 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  45.56 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  43.57 
 
 		 352 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  42.18 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  42.69 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  40.71 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  34.79 
 
 		 390 aa  216  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 		 350 aa  205  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  34.57 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  32.8 
 
 		 398 aa  192  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  34.73 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  35.5 
 
 		 375 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.15 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  33.47 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 		 337 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  35.68 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.63 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.14 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  27.19 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  29.91 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  25.88 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  30.26 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.55 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  24.72 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  29.61 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  32.75 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  21.88 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  32.75 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  32.16 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  29.13 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  25.43 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  26.94 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.93 
 
 		 428 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.93 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.85 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  29.57 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  30.68 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 412 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 361 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 		 342 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  25.21 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  23.38 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  25.21 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  28.51 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.64 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  25.14 
 
 		 345 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>