More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3975 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  91.41 
 
 		 361 aa  682    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  729    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  58.46 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.11 
 
 		 312 aa  249  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  41.64 
 
 		 310 aa  243  5e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  43.67 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  43.11 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  40.68 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  42.17 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  37.38 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  40.3 
 
 		 328 aa  209  8e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  40.2 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  38.91 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  39.27 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  36.94 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  35.87 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 		 359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  34.58 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  34.06 
 
 		 353 aa  177  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  34.58 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  34.58 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  35.51 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  37.74 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  33.63 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  35.56 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  34.06 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  34.91 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 335 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  32.84 
 
 		 354 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  33.75 
 
 		 346 aa  169  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  34.94 
 
 		 334 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  36.7 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  33.75 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  32.74 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  34.66 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  32.92 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  32.7 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  32.61 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  33.45 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  33.45 
 
 		 340 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  35.45 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  31.93 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  34.23 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.49 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  30.82 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.3 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  34.6 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.44 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  33.43 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 311 aa  143  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  35.31 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  30.77 
 
 		 302 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  32.32 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  31.43 
 
 		 649 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  32.28 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  30.33 
 
 		 350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  32.28 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  33.11 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  29.55 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  31.42 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 		 358 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  29.68 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  31.38 
 
 		 370 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  27.99 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.7 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  29.36 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.12 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 345 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>