More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0901 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  100 
 
 
302 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  47.12 
 
 
310 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 
331 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  35.95 
 
 
332 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  33.97 
 
 
345 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  33.88 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  34.97 
 
 
332 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  33.65 
 
 
346 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  34.24 
 
 
334 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  33.88 
 
 
335 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.58 
 
 
288 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.17 
 
 
288 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.17 
 
 
288 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  31.37 
 
 
328 aa  142  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 
344 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 
344 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  32.41 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.32 
 
 
286 aa  140  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 
361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.72 
 
 
312 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  28.03 
 
 
332 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  31.08 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  30.56 
 
 
313 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 
361 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.03 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 
338 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 
360 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  30.74 
 
 
332 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  25.16 
 
 
354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  27.71 
 
 
353 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
320 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
355 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 
350 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 
355 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0052  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.33 
 
 
289 aa  105  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  28.11 
 
 
334 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 
359 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 
350 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 
359 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  27.31 
 
 
335 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  28.96 
 
 
347 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  26.51 
 
 
335 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  26.91 
 
 
334 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  23.4 
 
 
356 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  26.43 
 
 
350 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  26.1 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 
350 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  24.6 
 
 
319 aa  95.9  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  26.1 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  24.9 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  24.5 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
310 aa  94  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.45 
 
 
337 aa  94  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  24.1 
 
 
340 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  28.8 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 
310 aa  92.8  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  24.92 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 
323 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 
358 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0687  oxidoreductase family protein  25.25 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00761279  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0987  oxidoreductase family protein  28.66 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.827263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  25.99 
 
 
352 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  32.22 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 
315 aa  89.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.89 
 
 
357 aa  89  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 
317 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  26.88 
 
 
335 aa  85.5  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  30.9 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  30.9 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  22.47 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  25 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  26.75 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  23.37 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  32.78 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  23.74 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.02 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  25.16 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.31 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  24.46 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.11 
 
 
317 aa  79  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>