More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3241 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  95.14 
 
 		 350 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 350 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  95.14 
 
 		 350 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  88.25 
 
 		 350 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  77.65 
 
 		 352 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  69.94 
 
 		 347 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  49.42 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  47.32 
 
 		 368 aa  307  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  47.2 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  42.6 
 
 		 345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  47.65 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  43.15 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  44.22 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  45.75 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  45.86 
 
 		 355 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  42.57 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  43.27 
 
 		 352 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  41.59 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  40.41 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  35.62 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  34.57 
 
 		 374 aa  205  8e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  32.54 
 
 		 398 aa  192  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  34.73 
 
 		 335 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  36.55 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  35.93 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.75 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  33.05 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  24.54 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 357 aa  109  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  31.1 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.47 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  30.77 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 377 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.83 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  24.72 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.5 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  29.43 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  26.54 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  31.88 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 333 aa  99.4  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  32.19 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  31.17 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  27.6 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  30.43 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.61 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  26.54 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.16 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  26.26 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  34.21 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.91 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  26.75 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.16 
 
 		 331 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  26.89 
 
 		 334 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.93 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  23.33 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>