More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0898 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
353 aa  709    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  45.35 
 
 
350 aa  312  6.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  42.53 
 
 
359 aa  281  9e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  35.82 
 
 
366 aa  220  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  40.12 
 
 
344 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  37.28 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  40.12 
 
 
349 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  35.53 
 
 
343 aa  186  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  37.54 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  35.98 
 
 
333 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  34.96 
 
 
387 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 
412 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  29.12 
 
 
331 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 
359 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  33.52 
 
 
388 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  35.26 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  37.72 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 
357 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
358 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 
360 aa  160  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 
360 aa  160  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 
383 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  34.59 
 
 
345 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
337 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 
356 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  35.69 
 
 
341 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
374 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 
377 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
326 aa  146  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  31.46 
 
 
334 aa  146  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  33.52 
 
 
375 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  32.24 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  28.65 
 
 
353 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
388 aa  133  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  31.75 
 
 
400 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 
350 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  30.64 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  32.27 
 
 
349 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  28.3 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 
387 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
335 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 
365 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
364 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 
361 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
342 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  27.92 
 
 
356 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
373 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  33.69 
 
 
351 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 
391 aa  116  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  23.48 
 
 
363 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  33.98 
 
 
365 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 
329 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 
332 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
338 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
369 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  30.07 
 
 
347 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 
351 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  31.36 
 
 
352 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
334 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 
393 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  30 
 
 
339 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  29.23 
 
 
338 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  35.57 
 
 
353 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  29.7 
 
 
347 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  33.21 
 
 
390 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 
333 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 
353 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  34.47 
 
 
357 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 
357 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
375 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  25.42 
 
 
336 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 
359 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 
366 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
334 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
371 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  27.8 
 
 
335 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  30.71 
 
 
330 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 
338 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 
358 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
373 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  32.95 
 
 
351 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
351 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  30 
 
 
341 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  32.95 
 
 
351 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  32.95 
 
 
351 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  32.95 
 
 
351 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
356 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  32.95 
 
 
351 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  32.95 
 
 
347 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 
350 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>