More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 404 aa  807    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  59.5 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  47.95 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  46.95 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  45.32 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  42.68 
 
 		 355 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  44.25 
 
 		 400 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  39.94 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  31.83 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  33.04 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  33.15 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  35.92 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  33.03 
 
 		 361 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 350 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.97 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 366 aa  149  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  31.93 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 353 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 350 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27.25 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 		 356 aa  121  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 		 357 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 352 aa  116  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  28.26 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.61 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  31.5 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  31.42 
 
 		 333 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  28.46 
 
 		 363 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  27.27 
 
 		 370 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  31.07 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.75 
 
 		 353 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31.76 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  30.24 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  30.36 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  30.36 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  30.36 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  30.36 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  30.36 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 		 334 aa  99.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  28.74 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 349 aa  96.7  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  32.63 
 
 		 335 aa  96.3  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 359 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  33.73 
 
 		 344 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  32.62 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>