More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1636 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 341 aa  707    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  78.82 
 
 		 349 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0114  oxidoreductase domain-containing protein  45.73 
 
 		 357 aa  272  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0048  oxidoreductase domain protein  40.99 
 
 		 364 aa  238  8e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4660  oxidoreductase domain protein  37.11 
 
 		 374 aa  219  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  37.66 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.78 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3409  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 365 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.137332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 		 347 aa  99.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  27.32 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.2 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.72 
 
 		 428 aa  92.4  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.64 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  27.32 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  23.63 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.71 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 		 388 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.6 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.6 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  25.87 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  21.93 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  22.44 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  34.38 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.43 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  34.9 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.92 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  21.15 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.05 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  34.07 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  24.7 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  26.51 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 421 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  24.89 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  27.11 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.47 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.9 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  25.22 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  25.44 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.23 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 		 462 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.43 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  34.04 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  24.13 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  25.92 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  24.43 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  26.24 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 665 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  24.34 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  21.92 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>