More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1997 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
344 aa  707    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  42.73 
 
 
351 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  37.69 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  37.01 
 
 
344 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  38.1 
 
 
352 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  37.98 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  33.44 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 
341 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 
347 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
345 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  28.03 
 
 
341 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
353 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  29.92 
 
 
368 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 
362 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  26.12 
 
 
376 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  26.12 
 
 
376 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
336 aa  99.8  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.84 
 
 
312 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 
360 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
349 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  26.62 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  25.39 
 
 
330 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  29.06 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  29.06 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  29.06 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  29.06 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  29.29 
 
 
347 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  29.06 
 
 
351 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  34.03 
 
 
348 aa  86.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  26.78 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
368 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.05 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 
699 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  22.9 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.5 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  26.25 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
699 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 
373 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
425 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  24.59 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.6 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  29.45 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  24.13 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  24.25 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4569  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.29 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3270  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  22.71 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  24.05 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  25.11 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  24.9 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.25 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4098  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1884  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
1080 aa  72.8  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.08 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>