More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1379 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  100 
 
 		 362 aa  748    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  51.61 
 
 		 349 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  39.85 
 
 		 325 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  39.33 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 		 346 aa  166  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65576  predicted protein  32.08 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  23.71 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.52 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05970  conserved hypothetical protein  25.07 
 
 		 358 aa  89.4  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.23 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.95 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07353  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16380)  28.12 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.550714 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 340 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  25.74 
 
 		 322 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  27.64 
 
 		 327 aa  86.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  23.86 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  22.41 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  25.86 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.56 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  22.44 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  24.26 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  29.52 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  30.41 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  27.45 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.22 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.23 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  28.62 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  25.61 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  25.8 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.07 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  30.21 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  25.32 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  25.89 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.65 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  25.97 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.81 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 		 667 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.28 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.28 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.28 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  24.25 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>