More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2234 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 354 aa  739    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  50.31 
 
 		 327 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  51.69 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  49.33 
 
 		 331 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  46.44 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  43.35 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  42.59 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 		 320 aa  166  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  27.24 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 329 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  34.39 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.48 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 		 376 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.49 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  29.71 
 
 		 438 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.27 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 332 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 329 aa  92.8  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 367 aa  92.8  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 356 aa  92.4  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  34.72 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2956  oxidoreductase-like  28.41 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  28.05 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  33.83 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.52 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 		 325 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 376 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  34.46 
 
 		 667 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  28.79 
 
 		 344 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  32.16 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 345 aa  89.4  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  25.82 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.69 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  32.21 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  32.99 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  32.99 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  32.99 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.69 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  33.17 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  33.17 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  28.07 
 
 		 346 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  33.17 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.37 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.04 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  33.17 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 327 aa  86.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 329 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  31.73 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  31.64 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  31.73 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>