More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5416 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
385 aa  799    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 
393 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0358  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
427 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 
381 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.33 
 
 
369 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 
321 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  31.98 
 
 
329 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
347 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 
381 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 
329 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
344 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 
382 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  26.51 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  32.45 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 
373 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
321 aa  96.7  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.92 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 
331 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 
344 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  30.65 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  38.13 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  34.18 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
321 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.12 
 
 
343 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.12 
 
 
343 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 
359 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.68 
 
 
343 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.68 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  31.09 
 
 
360 aa  93.2  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 
343 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 
324 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 
385 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.23 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.23 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  33.15 
 
 
667 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 
344 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.07 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  38.57 
 
 
342 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  33.79 
 
 
408 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.23 
 
 
343 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  45.65 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  31.89 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  28.02 
 
 
328 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  29.32 
 
 
388 aa  90.9  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  36.53 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 
405 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
363 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 
376 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  37.59 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 
327 aa  90.5  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 
358 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  33.86 
 
 
369 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  28.7 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 
337 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  27.43 
 
 
365 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.79 
 
 
343 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 
344 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.79 
 
 
343 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  29.29 
 
 
347 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  31.44 
 
 
371 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 
372 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  26.09 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  30.54 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  36.18 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  30.29 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  30.11 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  26.44 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  33.33 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  32.47 
 
 
330 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  35.67 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  35.84 
 
 
371 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 
338 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  34.51 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  29.15 
 
 
337 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 
331 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  26.12 
 
 
368 aa  87  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  32.27 
 
 
327 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>