More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5840 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  94.87 
 
 
409 aa  810    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  100 
 
 
409 aa  846    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  95.35 
 
 
409 aa  810    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
409 aa  846    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  95.35 
 
 
409 aa  811    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  95.35 
 
 
409 aa  811    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  94.87 
 
 
409 aa  810    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  95.35 
 
 
409 aa  811    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  95.35 
 
 
409 aa  811    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  37.93 
 
 
400 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  35.22 
 
 
391 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  35.16 
 
 
395 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  35.16 
 
 
395 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  37.28 
 
 
404 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  34.96 
 
 
399 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.78 
 
 
428 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.78 
 
 
329 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.38 
 
 
312 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  35.52 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  35.52 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  34.13 
 
 
337 aa  92.8  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  35.52 
 
 
367 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  35.52 
 
 
367 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  33.02 
 
 
376 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  38.26 
 
 
375 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  32.81 
 
 
335 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  23.77 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  32.18 
 
 
372 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 
372 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 
311 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
372 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  32.84 
 
 
344 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  29.21 
 
 
344 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.84 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.41 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 
377 aa  86.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 
345 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  30.99 
 
 
375 aa  86.3  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 
369 aa  86.3  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  35.53 
 
 
341 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  29.41 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  36.18 
 
 
341 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  29.95 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  34 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 
667 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  34.72 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 
331 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  41.51 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  31.19 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
699 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.42 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  40.2 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 
344 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  33.77 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  37.23 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  39.22 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  34.12 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.84 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  33.79 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>