More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4060 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 370 aa  749    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  75.85 
 
 		 371 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  62.14 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  62.91 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  59.12 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  55.91 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  42.43 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  43.84 
 
 		 350 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  41.89 
 
 		 341 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  43.07 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  41.89 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  43.07 
 
 		 345 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  43.41 
 
 		 341 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  43.92 
 
 		 339 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  40 
 
 		 337 aa  275  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  40.65 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  40.06 
 
 		 328 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  40.8 
 
 		 352 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  43.33 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  41.64 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  38.91 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  36.94 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  37.98 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  36.07 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  31.77 
 
 		 353 aa  173  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 		 315 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.73 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  33.84 
 
 		 517 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  30.23 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  33.84 
 
 		 517 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  34.15 
 
 		 330 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  30.59 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  36.89 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.12 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.46 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  29.64 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  36.58 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  35.53 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.81 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  35.27 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  31.38 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  33.46 
 
 		 344 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  34.62 
 
 		 310 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  32.49 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  35.36 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  28.53 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  35.04 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 314 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 335 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  34.85 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  31.91 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  31.66 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.74 
 
 		 310 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  29.82 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  31.76 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  34.15 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  27.11 
 
 		 327 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 327 aa  93.2  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.61 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  39.58 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 667 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  37.32 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.87 
 
 		 317 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  28.03 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  37.75 
 
 		 665 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 323 aa  90.5  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  29.96 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  31.42 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 347 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  29.17 
 
 		 332 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  28.73 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.57 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 375 aa  85.9  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  24.78 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  34.67 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  24.78 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>