More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8501 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 358 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  63.37 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  61.76 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  62.14 
 
 		 370 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  60.95 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  60.24 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  45.59 
 
 		 345 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  48.09 
 
 		 345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  47.8 
 
 		 345 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 		 341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  45.51 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  45.51 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  45.05 
 
 		 342 aa  288  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  41.98 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  45.05 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  40.76 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  40.83 
 
 		 337 aa  280  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  41.67 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  42.69 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  39.53 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  41.77 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  38.15 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  37.68 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  36.68 
 
 		 344 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  35.48 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 517 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  36.5 
 
 		 517 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  31.62 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  32.77 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 353 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.58 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  33.03 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  29.94 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31 
 
 		 318 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.7 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 		 361 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  32.23 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 344 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  31.18 
 
 		 361 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  34.84 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.86 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  33.2 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  33.11 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  32.81 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  32.64 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  26.25 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  30.79 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.38 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  32.72 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  28.79 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  29.05 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  28.66 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  30.34 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.17 
 
 		 329 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  32.42 
 
 		 320 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.41 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  27.19 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 376 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.41 
 
 		 428 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.89 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  28.96 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 		 310 aa  87.4  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  28.2 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  31.32 
 
 		 318 aa  85.9  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3638  oxidoreductase domain-containing protein  31.89 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.07 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  25.16 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  24.14 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>