More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1957 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  100 
 
 
341 aa  691    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  38.28 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 
359 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 
347 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 
345 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  38.01 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  34.44 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  36.44 
 
 
353 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  35.91 
 
 
344 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
350 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 
337 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  35.83 
 
 
387 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  36.59 
 
 
412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  34.75 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 
359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 
387 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
366 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
358 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  33.2 
 
 
377 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 
356 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 
333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  32.29 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  36.28 
 
 
352 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  28.15 
 
 
363 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.08 
 
 
329 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.08 
 
 
428 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
350 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  33 
 
 
357 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  30.08 
 
 
370 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.08 
 
 
356 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 
369 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  34.98 
 
 
378 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 
383 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  37.67 
 
 
388 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
374 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  32.57 
 
 
360 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  31.71 
 
 
353 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  34.52 
 
 
359 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
339 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 
342 aa  99.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  35.67 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 
358 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
326 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 
335 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
350 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
393 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 
391 aa  93.2  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.68 
 
 
364 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 
388 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  32.64 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  30.36 
 
 
387 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 
320 aa  90.5  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 
321 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  31.71 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 
385 aa  89.4  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.49 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  32.94 
 
 
386 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  35.39 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  30.05 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  28.33 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  28.33 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  28.33 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  32.39 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  28.33 
 
 
367 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  31.86 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
385 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 
358 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  26.48 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  23.94 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>