More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0546 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 327 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  69.44 
 
 		 324 aa  468  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  50.91 
 
 		 331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  50.31 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  49.54 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  45.94 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  42.81 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  38.01 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 347 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  28.75 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  31.73 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.92 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  26.35 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 367 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 376 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  28.29 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 		 338 aa  99.4  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 332 aa  99.4  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.16 
 
 		 428 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.16 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.76 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.08 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  31.66 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  30.17 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  26.55 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 		 367 aa  95.9  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  28.19 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  29.31 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  30.38 
 
 		 371 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  27.84 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  30.38 
 
 		 371 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  28.9 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.42 
 
 		 387 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 		 343 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  25.52 
 
 		 329 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 342 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  27.83 
 
 		 344 aa  92.4  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 376 aa  92.4  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  25.86 
 
 		 327 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 340 aa  92.4  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  27.24 
 
 		 438 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.41 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 405 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  27.13 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.5 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  28.69 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 		 381 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  28.1 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 		 370 aa  89.7  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  26.14 
 
 		 362 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.58 
 
 		 353 aa  89.4  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.34 
 
 		 338 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 385 aa  89.4  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1364  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 		 353 aa  89.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 		 371 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.69 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  29.81 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 667 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  25.51 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 		 667 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 458 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>