More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2322 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  36.42 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  34.16 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  35.47 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 		 324 aa  188  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  34.07 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  35.59 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 342 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.14 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.45 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 325 aa  85.9  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  27.24 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.61 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.43 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  24.71 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 667 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  21.53 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.26 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  40.82 
 
 		 667 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  25.98 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  29.21 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  37.41 
 
 		 667 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.82 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.69 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  24.55 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  29.45 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.1 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  21.53 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.75 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.75 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  28.16 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.85 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  22.9 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  24.12 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  25.4 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  27.27 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  29.14 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  40 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  40 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  31.17 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.19 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  27.04 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  23.89 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  23.98 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  40 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  27.65 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.19 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  30.28 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  24.39 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  27.37 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>