More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3940 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  100 
 
 
330 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  58.01 
 
 
333 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.27 
 
 
333 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.27 
 
 
333 aa  349  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  55.45 
 
 
333 aa  335  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  53.82 
 
 
345 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  55.32 
 
 
336 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  49.38 
 
 
331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  49.54 
 
 
334 aa  298  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  46.65 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  44.82 
 
 
336 aa  242  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  38.58 
 
 
340 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 
356 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.24 
 
 
370 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 
331 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  32.09 
 
 
343 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  36.16 
 
 
342 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  34.07 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  34.07 
 
 
342 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
435 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
435 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
363 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  30.94 
 
 
322 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  34.42 
 
 
334 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28.78 
 
 
334 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 
347 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 
357 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 
331 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.74 
 
 
388 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  26.47 
 
 
438 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.09 
 
 
327 aa  99.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
332 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.62 
 
 
338 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  34.16 
 
 
329 aa  95.9  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 
432 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 
337 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  34.22 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 
334 aa  92.8  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 
433 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
458 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
358 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  34.62 
 
 
325 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  35.62 
 
 
376 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  27.92 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  28.27 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  26.82 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  28.7 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 
396 aa  89.7  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.2 
 
 
350 aa  89.7  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.16 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.64 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  34.85 
 
 
328 aa  89.4  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
345 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  27.81 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  27.14 
 
 
337 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 
381 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  34.22 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  30.31 
 
 
321 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  25.89 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  34.46 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.66 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 
468 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 
349 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 
342 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 
387 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  29.53 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 
330 aa  85.9  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  32.45 
 
 
386 aa  85.9  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  33.69 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  33.52 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  29.64 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>