More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4105 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 340 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  40.53 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  41.67 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  40.6 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  42.43 
 
 		 345 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.76 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.47 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  43.2 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  39.47 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  38.35 
 
 		 330 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  37.39 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 		 342 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 321 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 		 667 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  32.27 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  37.24 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.51 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.51 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.45 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  35.98 
 
 		 342 aa  99.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  41.53 
 
 		 665 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  39.24 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  31.41 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.95 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  37.31 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 667 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 		 376 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 435 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2277  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 345 aa  96.3  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  35.43 
 
 		 325 aa  95.9  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.51 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  26.13 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 433 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  37.82 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  23.43 
 
 		 468 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  29.1 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  39.74 
 
 		 330 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 326 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  38.82 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.05 
 
 		 371 aa  92.8  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 432 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  25.44 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  29.3 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  34.54 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  27.31 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  31.17 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  26.63 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 667 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.52 
 
 		 388 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  30.07 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 667 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 		 377 aa  89.7  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 		 435 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  36.54 
 
 		 352 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.32 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  31.43 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  29.3 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  36.71 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  36.27 
 
 		 670 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  26.93 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  36.71 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  28.21 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.83 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  25.57 
 
 		 375 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 393 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 435 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  34.47 
 
 		 346 aa  86.3  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 		 385 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>