More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01940 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  70.44 
 
 		 319 aa  437  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3179  oxidoreductase domain protein  55.76 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  48.44 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1364  oxidoreductase domain-containing protein  48.9 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  38.53 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  38.05 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  33.75 
 
 		 347 aa  95.9  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 363 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 665 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 		 376 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.6 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.6 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  30.6 
 
 		 377 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 		 356 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 340 aa  85.9  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  31.54 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  31.66 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  30.47 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.35 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.54 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.86 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.86 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.41 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  29.62 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 		 644 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.99 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  28.31 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5793  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.47 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.27 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.74 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  26.59 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.06 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.45 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  31.4 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  30.8 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>