More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01210 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  100 
 
 
319 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  70.44 
 
 
317 aa  437  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3179  oxidoreductase domain protein  55.45 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 
332 aa  282  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1364  oxidoreductase domain-containing protein  48.44 
 
 
332 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 
334 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  41.95 
 
 
346 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  35.82 
 
 
338 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
335 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 
347 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  34.47 
 
 
377 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  31.32 
 
 
344 aa  92.8  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 
332 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
340 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 
347 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  31.93 
 
 
331 aa  89.4  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 
331 aa  89  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  32.6 
 
 
347 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 
356 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  33.47 
 
 
349 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 
665 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  29.54 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27.59 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  29.79 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 
372 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  29.36 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.28 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.41 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  31 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.98 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  40.77 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  30.92 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  30.59 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  31.98 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  33.33 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4098  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 
373 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  24.55 
 
 
331 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 
376 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  30.93 
 
 
358 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 
353 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 
359 aa  77  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  33.94 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  36.05 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.12 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  29.74 
 
 
644 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  32.97 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  27.31 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.66 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  34.69 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>