More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1364 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1364  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  680    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  85.8 
 
 
332 aa  586  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  48.9 
 
 
317 aa  295  9e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  48.44 
 
 
319 aa  276  5e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3179  oxidoreductase domain protein  45.57 
 
 
332 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
332 aa  129  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 
338 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 
353 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  32.17 
 
 
353 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 
363 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  28.49 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 
335 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 
368 aa  92.4  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.38 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  32.23 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 
342 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
347 aa  89  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  34.96 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  29.8 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.34 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  27.44 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  34.87 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  32.29 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29.22 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.91 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 
388 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
435 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  30.77 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.74 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3617  oxidoreductase domain-containing protein  27.87 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  29.83 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.4 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 
369 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  25.92 
 
 
358 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
435 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.37 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0518  oxidoreductase domain-containing protein  27.87 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  33.12 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  23.03 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.17 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  29.09 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
667 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1882  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000416428  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.17 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.55 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  30.3 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>