More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4613 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
342 aa  703    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  55.82 
 
 
345 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  57.89 
 
 
339 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  55.75 
 
 
345 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  55.46 
 
 
345 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  52.24 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  56.33 
 
 
352 aa  391  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  54.33 
 
 
333 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  53.24 
 
 
341 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  52.06 
 
 
341 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  51.76 
 
 
341 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  50.45 
 
 
328 aa  358  9e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  47.89 
 
 
337 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  45.23 
 
 
340 aa  299  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  45.43 
 
 
347 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  41.06 
 
 
363 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  42.94 
 
 
387 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  45.05 
 
 
358 aa  288  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  43.95 
 
 
371 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  43.33 
 
 
370 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  42.22 
 
 
364 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 
351 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 
334 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  33.03 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  28.72 
 
 
375 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
343 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
343 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
517 aa  156  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  30.82 
 
 
517 aa  156  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  30.88 
 
 
344 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 
353 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31.69 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.48 
 
 
317 aa  143  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  29.13 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 
318 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.66 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.71 
 
 
318 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
361 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.08 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
311 aa  112  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.81 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  28.28 
 
 
345 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
315 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 
360 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
327 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  26.87 
 
 
310 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  28.31 
 
 
332 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
355 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 
344 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 
363 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  30.37 
 
 
332 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.58 
 
 
428 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  29.5 
 
 
328 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.66 
 
 
329 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.27 
 
 
346 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
322 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 
337 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
359 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  26.4 
 
 
354 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  27.81 
 
 
334 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  25.45 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.9 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  27.66 
 
 
319 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  27.08 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 
371 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 
376 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  23.01 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  26.68 
 
 
371 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  30.89 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  27.71 
 
 
332 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  25.86 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  27.19 
 
 
335 aa  93.2  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  25.34 
 
 
366 aa  93.2  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  23.24 
 
 
334 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  35.17 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  25.61 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>