More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0112 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
358 aa  717    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1058  oxidoreductase domain-containing protein  53.82 
 
 
342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3492  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  41.42 
 
 
339 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00854332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  41.72 
 
 
339 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2993  oxidoreductase domain protein  43.77 
 
 
354 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00237392  hitchhiker  0.000625916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4127  oxidoreductase domain protein  44.02 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  38.76 
 
 
363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  39.72 
 
 
358 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  37.46 
 
 
350 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  38.1 
 
 
357 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3270  oxidoreductase domain protein  41.79 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  38.3 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  34.33 
 
 
349 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  34.33 
 
 
349 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  34.33 
 
 
349 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 
348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.61 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6241  oxidoreductase domain protein  37.54 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  34.02 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  33.88 
 
 
359 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  33.88 
 
 
359 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  34.66 
 
 
358 aa  172  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
346 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
346 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
346 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
346 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
353 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  33.61 
 
 
359 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  33.81 
 
 
346 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  33.81 
 
 
346 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  33.81 
 
 
346 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  33.81 
 
 
346 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  32.76 
 
 
346 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  33.33 
 
 
350 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1980  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 
347 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.36 
 
 
343 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  33.81 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.07 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  31.28 
 
 
360 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 
349 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  32.18 
 
 
346 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  29.77 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  34.73 
 
 
357 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 
362 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 
346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  31.96 
 
 
349 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 
343 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  31.01 
 
 
342 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.24 
 
 
343 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.24 
 
 
343 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  34.54 
 
 
350 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  31.66 
 
 
349 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
344 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  31.67 
 
 
346 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.95 
 
 
343 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.95 
 
 
343 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.95 
 
 
343 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.07 
 
 
343 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 
337 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  32.16 
 
 
336 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.78 
 
 
343 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  33.15 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 
361 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 
346 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 
347 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
346 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  31.74 
 
 
348 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.3 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  31.44 
 
 
348 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.14 
 
 
350 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  33.14 
 
 
350 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 
348 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 
345 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.78 
 
 
367 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.78 
 
 
367 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  33.43 
 
 
350 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.14 
 
 
350 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
347 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.14 
 
 
350 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15440  predicted dehydrogenase  33.06 
 
 
343 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
333 aa  142  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  33.7 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1479  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  27.54 
 
 
336 aa  136  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.3 
 
 
353 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.3 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  27.6 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  34.1 
 
 
376 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.3 
 
 
353 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.3 
 
 
353 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  27.76 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  29.92 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  32.86 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.84 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  32.83 
 
 
383 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  32.58 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  32.58 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>