More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2321 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
357 aa  709    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  57.35 
 
 
346 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  57.35 
 
 
346 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  57.35 
 
 
346 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  57.35 
 
 
346 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  56.76 
 
 
346 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  56.27 
 
 
346 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  57.02 
 
 
346 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  54.7 
 
 
348 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  55.98 
 
 
346 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  55.98 
 
 
359 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  55.98 
 
 
346 aa  384  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  54.42 
 
 
348 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  55.98 
 
 
359 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  55.69 
 
 
346 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  55.34 
 
 
374 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  55.69 
 
 
359 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  55.98 
 
 
346 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  56.27 
 
 
346 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  54.42 
 
 
349 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  54.42 
 
 
349 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  54.42 
 
 
349 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  53.54 
 
 
349 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  55.04 
 
 
350 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  51.99 
 
 
349 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  50.85 
 
 
348 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  54.34 
 
 
346 aa  343  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  54.6 
 
 
345 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  50.29 
 
 
350 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  54.62 
 
 
376 aa  325  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  48.55 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  52.87 
 
 
383 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  42.29 
 
 
343 aa  309  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  47.46 
 
 
361 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  42.29 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  42 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  41.14 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.57 
 
 
343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.57 
 
 
343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  50.61 
 
 
358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  50.61 
 
 
358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  50.43 
 
 
349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.14 
 
 
343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.29 
 
 
343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  42.29 
 
 
343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  41.14 
 
 
343 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  49.28 
 
 
360 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.14 
 
 
343 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  48.55 
 
 
349 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3878  oxidoreductase domain protein  48.55 
 
 
349 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.42 
 
 
350 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.88 
 
 
350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  46.88 
 
 
350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  43.35 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  43.84 
 
 
346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  47.85 
 
 
347 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.61 
 
 
367 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.61 
 
 
367 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.88 
 
 
350 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.88 
 
 
350 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  47.16 
 
 
350 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.4 
 
 
346 aa  276  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  37.46 
 
 
346 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  45.2 
 
 
350 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  39.27 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0145  oxidoreductase domain-containing protein  45.2 
 
 
350 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550322  normal  0.534197 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  44.35 
 
 
350 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  44.35 
 
 
350 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  42.36 
 
 
355 aa  252  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3327  oxidoreductase-like  44.63 
 
 
350 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  36.47 
 
 
348 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  35.98 
 
 
344 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0161  oxidoreductase domain-containing protein  44.22 
 
 
341 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0147  oxidoreductase domain-containing protein  44.22 
 
 
341 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 
333 aa  242  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  38.95 
 
 
346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  37.12 
 
 
360 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  42.29 
 
 
363 aa  238  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  41.76 
 
 
350 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  37.57 
 
 
336 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6241  oxidoreductase domain protein  44.16 
 
 
332 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  40.4 
 
 
353 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  36.18 
 
 
346 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  37.88 
 
 
347 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  33.72 
 
 
346 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 
337 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  41.06 
 
 
358 aa  215  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  39.31 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  40.11 
 
 
345 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 
362 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3848  putative dehydrogenase  35.07 
 
 
345 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  34.78 
 
 
345 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  34.59 
 
 
345 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  35.21 
 
 
345 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  34.78 
 
 
345 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  35.21 
 
 
345 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  38.31 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  34.49 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  36.81 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  34.3 
 
 
345 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>