More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3425 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 
353 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  96.03 
 
 
353 aa  708    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  96.32 
 
 
353 aa  710    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  95.75 
 
 
353 aa  704    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  95.47 
 
 
353 aa  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  96.88 
 
 
353 aa  712    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  96.6 
 
 
353 aa  714    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3205  oxidoreductase, C-terminus  97.01 
 
 
234 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  52.45 
 
 
345 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  52.45 
 
 
345 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  52.16 
 
 
345 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  52.16 
 
 
345 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  52.16 
 
 
345 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  52.16 
 
 
345 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  51.87 
 
 
345 aa  358  9e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3848  putative dehydrogenase  51.59 
 
 
345 aa  358  9e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  52.16 
 
 
345 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  51.3 
 
 
345 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  51.01 
 
 
345 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  50.72 
 
 
345 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  51.01 
 
 
345 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  51.01 
 
 
345 aa  348  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  49.56 
 
 
346 aa  343  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  49.11 
 
 
339 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3885  oxidoreductase, NAD-binding  47.26 
 
 
308 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1192  dehydrogenase  40.62 
 
 
350 aa  289  4e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.59095  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0050  dehydrogenase or related protein  42.56 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3247  oxidoreductase domain protein  41.72 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  38.35 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3206  oxidoreductase, N-terminus  94.64 
 
 
112 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  34.57 
 
 
348 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 
347 aa  205  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.04 
 
 
343 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.04 
 
 
343 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.53 
 
 
343 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.53 
 
 
343 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.01 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.64 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 
343 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.04 
 
 
343 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.74 
 
 
346 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.23 
 
 
343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.74 
 
 
343 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.74 
 
 
343 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  32.44 
 
 
349 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  33.33 
 
 
336 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.69 
 
 
350 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  35.69 
 
 
350 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 
337 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
333 aa  189  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  34.35 
 
 
346 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  34.32 
 
 
346 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  33.72 
 
 
357 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  32.23 
 
 
346 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.4 
 
 
350 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.4 
 
 
350 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.4 
 
 
367 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.4 
 
 
367 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.63 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  34.03 
 
 
349 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  32.94 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  35.4 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  32.94 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  37 
 
 
346 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  32.06 
 
 
336 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  31.56 
 
 
346 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  32.14 
 
 
360 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  31.27 
 
 
349 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  31.27 
 
 
349 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  31.27 
 
 
349 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  30.34 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  31.56 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  34.03 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  28.74 
 
 
349 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  32.93 
 
 
346 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  31.27 
 
 
346 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  31.27 
 
 
346 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  31.27 
 
 
346 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3878  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 
349 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  30.5 
 
 
349 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  30.97 
 
 
346 aa  169  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  30.97 
 
 
346 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  30.97 
 
 
359 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  30.97 
 
 
359 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  30.97 
 
 
346 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  30.97 
 
 
359 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3327  oxidoreductase-like  33.53 
 
 
350 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  30.68 
 
 
346 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  30.97 
 
 
346 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
346 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  29.67 
 
 
350 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  33.23 
 
 
350 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  33.23 
 
 
350 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  29.97 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  29.46 
 
 
383 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>