More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1736 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 333 aa  689    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  46.53 
 
 		 348 aa  305  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  45.62 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  41.27 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  40.06 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  38.79 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  40.55 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  39.34 
 
 		 345 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  38.55 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  38.86 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  39.88 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  38.25 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  38.25 
 
 		 349 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  39.39 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  39.76 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  39.76 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  39.76 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  39.09 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  39.09 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  39.7 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  39.09 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  41.23 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  38.79 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  39.16 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  38.44 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  38.71 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  38.86 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  38.86 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  38.92 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  38.86 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  38.86 
 
 		 346 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  38.86 
 
 		 346 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  38.86 
 
 		 346 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  37.46 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  39.16 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  36.72 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.39 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37 
 
 		 343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.09 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  37.61 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.78 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.78 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.78 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.78 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  34.71 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  36.67 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  36.09 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.89 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.47 
 
 		 343 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  35.65 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  35.58 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  36.09 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.17 
 
 		 343 aa  208  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  38.53 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  35.65 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  34.25 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 		 347 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  35.24 
 
 		 349 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  35.8 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  36.18 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  36.09 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  36.39 
 
 		 345 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  36.39 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  36.09 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  36.09 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  36.09 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  36.09 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  36.09 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.65 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  35.49 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0050  dehydrogenase or related protein  33.74 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.82 
 
 		 353 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.51 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.51 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.6 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.02 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  34.02 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.53 
 
 		 353 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  35.8 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  35.5 
 
 		 345 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.74 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  35.21 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  34.34 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  34.74 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  35.5 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  35.21 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3848  putative dehydrogenase  34.91 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3885  oxidoreductase, NAD-binding  39.58 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  34.94 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 		 347 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  36.01 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  33.14 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.74 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  34.94 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>