More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3492 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3492  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  100 
 
 		 339 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00854332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  90.56 
 
 		 339 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4127  oxidoreductase domain protein  52.94 
 
 		 341 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  44.51 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  44.51 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3270  oxidoreductase domain protein  49.26 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  41.42 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  44.06 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2993  oxidoreductase domain protein  44.83 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00237392  hitchhiker  0.000625916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1058  oxidoreductase domain-containing protein  45.27 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  44.38 
 
 		 358 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  42.2 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  39.53 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  38.48 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  41.79 
 
 		 348 aa  212  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6241  oxidoreductase domain protein  41.67 
 
 		 332 aa  208  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1980  oxidoreductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315643  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  36.61 
 
 		 358 aa  203  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  34.11 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.6 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  38.48 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  35.29 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1479  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  36.26 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  37.54 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  35.45 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  33.8 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  38.3 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.38 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 361 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  35.59 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.09 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.61 
 
 		 343 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.61 
 
 		 343 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  35.92 
 
 		 350 aa  173  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.32 
 
 		 343 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.32 
 
 		 343 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.03 
 
 		 343 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.28 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15440  predicted dehydrogenase  38.46 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.74 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.45 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.36 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  36.36 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.88 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  29.74 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.88 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.88 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.88 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  33.8 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  35.61 
 
 		 346 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  34.48 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  34.48 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  34.48 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  32.85 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  35.59 
 
 		 350 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  34.2 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  35.14 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  34.2 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  32.5 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  32.57 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  33.61 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  33.33 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  36.42 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2033  oxidoreductase domain protein  36.06 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  33.06 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  32.86 
 
 		 348 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  31.9 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  36.31 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  31.49 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  31.49 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  31.49 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  35.19 
 
 		 383 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  29.41 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  34.9 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  29.45 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3878  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0145  oxidoreductase domain-containing protein  35.55 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550322  normal  0.534197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  31.92 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3327  oxidoreductase-like  33.63 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.6 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>