More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1123 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
349 aa  683    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  57.06 
 
 
376 aa  360  1e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  52.74 
 
 
350 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  57.52 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  57.52 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  53.37 
 
 
360 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  51.07 
 
 
348 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  51.07 
 
 
348 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  57.63 
 
 
383 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  51.22 
 
 
349 aa  328  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  50 
 
 
346 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  51.44 
 
 
361 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  52.82 
 
 
350 aa  322  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  50.61 
 
 
346 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  47.02 
 
 
348 aa  316  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  51.59 
 
 
357 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  49.26 
 
 
346 aa  315  7e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  49.26 
 
 
346 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  49.26 
 
 
346 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  49.26 
 
 
346 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  47.44 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  47.44 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  47.44 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  48.36 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  47.79 
 
 
359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  47.79 
 
 
359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  48.96 
 
 
346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  47.79 
 
 
359 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  48.06 
 
 
346 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  48.06 
 
 
346 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  48.06 
 
 
346 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  48.06 
 
 
346 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  48.66 
 
 
346 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  47.87 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  39.88 
 
 
342 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  50.74 
 
 
345 aa  293  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  46.5 
 
 
374 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  39.88 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.99 
 
 
343 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.29 
 
 
343 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.99 
 
 
343 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  39.29 
 
 
343 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.99 
 
 
343 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.99 
 
 
343 aa  278  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  39.29 
 
 
343 aa  278  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  45.54 
 
 
349 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  39.29 
 
 
343 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  39.88 
 
 
343 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.77 
 
 
350 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  47.77 
 
 
350 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.99 
 
 
350 aa  265  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  42.77 
 
 
336 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  48.07 
 
 
350 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.63 
 
 
367 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.63 
 
 
367 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.77 
 
 
350 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.77 
 
 
350 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  45.24 
 
 
349 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  47.35 
 
 
347 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.81 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3878  oxidoreductase domain protein  45.24 
 
 
349 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  39.76 
 
 
346 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  35.57 
 
 
346 aa  246  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  45.1 
 
 
350 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  37.54 
 
 
346 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  37.87 
 
 
346 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  36.15 
 
 
348 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  44.81 
 
 
350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  44.81 
 
 
350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0145  oxidoreductase domain-containing protein  45.7 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550322  normal  0.534197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3327  oxidoreductase-like  45.1 
 
 
350 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0161  oxidoreductase domain-containing protein  44.88 
 
 
341 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  37.13 
 
 
336 aa  228  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  34.64 
 
 
344 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0147  oxidoreductase domain-containing protein  44.88 
 
 
341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  43.97 
 
 
350 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  43.84 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  37.18 
 
 
355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  41.04 
 
 
363 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  35.82 
 
 
346 aa  219  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 
337 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 
347 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6241  oxidoreductase domain protein  41.42 
 
 
332 aa  205  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  33.99 
 
 
360 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  42.35 
 
 
345 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  37.68 
 
 
358 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2993  oxidoreductase domain protein  42.66 
 
 
354 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00237392  hitchhiker  0.000625916 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 
333 aa  193  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1980  oxidoreductase domain-containing protein  37.91 
 
 
347 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  37.54 
 
 
353 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  39.14 
 
 
358 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  40.52 
 
 
362 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4127  oxidoreductase domain protein  37.39 
 
 
341 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  32.74 
 
 
339 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  36.05 
 
 
339 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.14 
 
 
353 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.14 
 
 
353 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.86 
 
 
353 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  30.14 
 
 
353 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>