More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0518 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3617  oxidoreductase domain-containing protein  91.04 
 
 		 346 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0518  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 346 aa  708    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1882  oxidoreductase domain protein  68.5 
 
 		 348 aa  485  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000416428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1698  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 374 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1979  oxidoreductase domain protein  32.36 
 
 		 358 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000113132  normal  0.212354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4411  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0639  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  28.21 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1467  oxidoreductase-like  25.71 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.795298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3179  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2497  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1364  oxidoreductase domain-containing protein  27.87 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2847  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.14 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  29.58 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  35.48 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  33.08 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  23.2 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  21.05 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.85 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  27.86 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.59 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.07 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.85 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  27.83 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.42 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  24.27 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  30.68 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  21.68 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0838  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.4 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.74 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  22.95 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  27.02 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>