More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4411 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4411  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 363 aa  756    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1698  oxidoreductase domain protein  51.48 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1979  oxidoreductase domain protein  48.08 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000113132  normal  0.212354 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1882  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000416428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3617  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0518  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 		 346 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0639  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 332 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1467  oxidoreductase-like  24.07 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.795298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  22.04 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.1 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.17 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  24.7 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3179  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  26.55 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  26.09 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  22.09 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  22.11 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  23.97 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  23.39 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  20.77 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  26.71 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  23.45 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  23.27 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  23.22 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  23.39 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  22.01 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  22.71 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  23.78 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  25.57 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  22.98 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  23.86 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  22.77 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  21.97 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  21.96 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  22.13 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  23.84 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  23.83 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.45 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  28.65 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  22.31 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  22.18 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  22.43 
 
 		 667 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  22.67 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  22.71 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  29.65 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  21.91 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  25.86 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  22.68 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  26.71 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  20.73 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  24.82 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  24.9 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  22.75 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  21.55 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  23.33 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  21.96 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  20.12 
 
 		 333 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  24.2 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  27.94 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  23.48 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  20.12 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>