More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0600 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 427 aa  850    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  33.9 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  40.31 
 
 		 474 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  34.5 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  35.38 
 
 		 427 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  32.23 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  33.66 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  35.76 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  33.48 
 
 		 442 aa  203  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  35.44 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 		 470 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  33.08 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  32.59 
 
 		 495 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  34.98 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  33.11 
 
 		 493 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  31.54 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  37.14 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  37.29 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 699 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  26.35 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 399 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  29.43 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  25.79 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  29.03 
 
 		 390 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 416 aa  99.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  26.72 
 
 		 403 aa  97.8  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  23.82 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  23.22 
 
 		 421 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  33.86 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  39.01 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  41.13 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.75 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  26.02 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  33.12 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  26.18 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  22.95 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  25.65 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.03 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  41.35 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  29.03 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  31.65 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  32.87 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  28.26 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.84 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  20.4 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  33.15 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  33.09 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.7 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  30.39 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 346 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 734 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  34.06 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 		 715 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.56 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  28.47 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  23.17 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>