More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4326 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  732    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  49.27 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  48.17 
 
 		 373 aa  315  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  47.89 
 
 		 369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  47.79 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  45.36 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  46.94 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  48.15 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  43.8 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  42.3 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  43.8 
 
 		 377 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  44.44 
 
 		 379 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  43.53 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  45.2 
 
 		 370 aa  292  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  46.04 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  42.42 
 
 		 377 aa  288  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  44.14 
 
 		 382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  43.6 
 
 		 382 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  41.21 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  46.44 
 
 		 380 aa  275  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  41.57 
 
 		 367 aa  272  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  43.91 
 
 		 379 aa  268  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  40.72 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  38.16 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  43.6 
 
 		 371 aa  262  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  42.48 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  40.95 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  41.42 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  39.89 
 
 		 366 aa  242  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  40.85 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  38.76 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  41.95 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  40.52 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  42.9 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  37.36 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  39.23 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  36.64 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  39.83 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  40.29 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  35.5 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  35.46 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  34.4 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  34.37 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 		 644 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 372 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 364 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  28.24 
 
 		 657 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  30.51 
 
 		 665 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.69 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.69 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 341 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.37 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  24.93 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  33.17 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  33.93 
 
 		 321 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  25.27 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2847  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  29.14 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.27 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  36.7 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.96 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.15 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.83 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  36.97 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  36.75 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2497  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  24.78 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.17 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>