More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1698 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1698  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
374 aa  782    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4411  oxidoreductase domain protein  51.48 
 
 
363 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1979  oxidoreductase domain protein  49.03 
 
 
358 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000113132  normal  0.212354 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1882  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 
348 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000416428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3617  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 
346 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0518  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  23.58 
 
 
332 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1467  oxidoreductase-like  25.49 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.795298  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0639  oxidoreductase domain protein  23.01 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.65 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  24.52 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  23.8 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  23.63 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  23.32 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
359 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 
343 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  22.22 
 
 
334 aa  63.2  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  25.76 
 
 
342 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  26.3 
 
 
370 aa  62.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  23.9 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  25.6 
 
 
327 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  23.16 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  23.26 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  23.74 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 
357 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 
331 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  22.09 
 
 
321 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  24.01 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
365 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  23.72 
 
 
374 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  27.1 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  23.66 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  22.91 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  23.85 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 
405 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  25.31 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  26.53 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  24.8 
 
 
362 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.46 
 
 
438 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  23.31 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
321 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 
399 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  23.25 
 
 
325 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 
433 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  25.4 
 
 
393 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 
370 aa  56.6  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  21.93 
 
 
359 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  21.93 
 
 
359 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3442  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
351 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
367 aa  56.2  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  22.93 
 
 
363 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  21 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  23.43 
 
 
334 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  23.18 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 
359 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  22.98 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  22.54 
 
 
458 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  23.41 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  22.34 
 
 
667 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  30.2 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.42 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 
326 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>