More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1447 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
310 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  61.95 
 
 
321 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  28.99 
 
 
368 aa  93.2  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  36.76 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
350 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  32.4 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.74 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 
350 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  35.98 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  34.48 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  35.16 
 
 
369 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 
377 aa  82.4  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  30.84 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  33.17 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  30.84 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  30.84 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  30.29 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  31.89 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  34.87 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  30.1 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  31.47 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  34.3 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  32.84 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  30.74 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  33.2 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  34.91 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
333 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  29.55 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.48 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  32.49 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.24 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.56 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  24.41 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  31.47 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  29.5 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  34.45 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.6 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.27 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  30.05 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  30.8 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.03 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4127  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  32.7 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.75 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  24.77 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.03 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  33.49 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.46 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  28.08 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.03 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.17 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  33.49 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.48 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.58 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  25.91 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
1079 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.57 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.03 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.57 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>