More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1330 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 308 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  61.89 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  60.91 
 
 		 308 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  61.76 
 
 		 323 aa  371  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  59.61 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  57.7 
 
 		 311 aa  362  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  57.52 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  59.34 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  59.34 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  60.39 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  60.33 
 
 		 312 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  59.34 
 
 		 308 aa  348  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  57.98 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  59.15 
 
 		 312 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  59.94 
 
 		 318 aa  344  8.999999999999999e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  57.61 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  58.09 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  58.31 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  58.31 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  58.31 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  57 
 
 		 309 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  57 
 
 		 309 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  57.33 
 
 		 309 aa  338  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  57.98 
 
 		 309 aa  331  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  56.03 
 
 		 309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  54.43 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  60.73 
 
 		 313 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  58.69 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  50.16 
 
 		 308 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  50.33 
 
 		 308 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  46.41 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.36 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  30.77 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  35.44 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.21 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  33.78 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  34.9 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  32.19 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  33.58 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  32.19 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  28.38 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3234  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00108627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  36.84 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  26.04 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  26.12 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  26.64 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  25.45 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  36.22 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  37.1 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.77 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  27.45 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  23.51 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  29.41 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  28.87 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.71 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.27 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1980  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  26.4 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.46 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  26.4 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4385  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>