More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4245 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 303 aa  606  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  55.92 
 
 		 310 aa  338  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  58.17 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  54.75 
 
 		 308 aa  329  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  53.77 
 
 		 308 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  53.77 
 
 		 308 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  55.81 
 
 		 310 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  54.75 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  56.54 
 
 		 308 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  58.69 
 
 		 308 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  54.58 
 
 		 323 aa  309  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  54.28 
 
 		 311 aa  308  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  53.95 
 
 		 341 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  52.63 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  51.63 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  51.48 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  53.95 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  51.62 
 
 		 309 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  50.82 
 
 		 309 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  51.48 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  51.15 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  50.82 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  51.15 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  50.97 
 
 		 309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  51.97 
 
 		 309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  54.43 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  49.68 
 
 		 312 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  47.87 
 
 		 308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  49.35 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  46.56 
 
 		 308 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  43.46 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  27.08 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  27.08 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  27.08 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  27.08 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  26.56 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  28.06 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07353  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16380)  33.57 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.550714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  30.61 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  30.61 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3885  oxidoreductase, NAD-binding  26.56 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  26.56 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  26.56 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  26.56 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  26.56 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  26.56 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  30.1 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  30.1 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  30.1 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  29.41 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  25.52 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  26.04 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  30.1 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  33.06 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  32.2 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  27.92 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1364  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 		 341 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  33.07 
 
 		 355 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  29.75 
 
 		 346 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 332 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  43.28 
 
 		 389 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 412 aa  53.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  21.6 
 
 		 403 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  31.4 
 
 		 349 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  24.27 
 
 		 341 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 		 347 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 358 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.33 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 349 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.33 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 366 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 374 aa  52.8  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  29.51 
 
 		 349 aa  52.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  29.51 
 
 		 349 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  29.51 
 
 		 349 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 366 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 344 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>