More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3616 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  72.99 
 
 		 310 aa  451  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  60.84 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  61.02 
 
 		 308 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  56.27 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  55.95 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  59.67 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  58.77 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  58.77 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  58.12 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  58.63 
 
 		 311 aa  342  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  54.98 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  57.79 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  56.82 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  58.58 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  58.25 
 
 		 309 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  58.25 
 
 		 309 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  58.12 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  59.94 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  57.14 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  53.87 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  57.19 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  56.49 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  52.72 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  56.39 
 
 		 312 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  52.08 
 
 		 308 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  55.59 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  51.76 
 
 		 308 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  57.47 
 
 		 313 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  53.23 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  44.19 
 
 		 306 aa  229  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  36.3 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  29.21 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  29.21 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  27.89 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  31.87 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  34.88 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  30.87 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  36.8 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  35.23 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  26.6 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 		 669 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  38.1 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.97 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  30.81 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.86 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.23 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  28.06 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.23 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  26.63 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  36.21 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.23 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.86 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.86 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.86 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  24.23 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  33.87 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.95 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  38.38 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  21.66 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  26.92 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  28.35 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  28.35 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  25.26 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  28.35 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1980  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  28.29 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  33.06 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.08 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  28.43 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 		 347 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 347 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  30.67 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>