More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2924 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  729    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  24.48 
 
 		 337 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.86 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  30 
 
 		 404 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 385 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  32.08 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  32.26 
 
 		 330 aa  86.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  34.92 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  28.19 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  24.85 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  35.95 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  27.31 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.69 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  23.6 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  24.65 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  24.02 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  32.54 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  22.04 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.14 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  36.88 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  24.66 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.14 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  33.1 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  28.27 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  22.19 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  23.6 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  24.7 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  22.05 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  27.05 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  22.05 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  23.01 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  30.34 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1980  oxidoreductase domain-containing protein  31.22 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.57 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.57 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.25 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.57 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  28.1 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  26.22 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  25.72 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.57 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>