More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4981 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  100 
 
 
337 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 
354 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  26.93 
 
 
388 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
325 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 
365 aa  99.4  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.63 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  27.63 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.95 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
342 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 
355 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 
349 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1192  dehydrogenase  26 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.59095  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 
367 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 
325 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
359 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 
359 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  25.94 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  26.25 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 
374 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.38 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  28.46 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  28.35 
 
 
336 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
361 aa  89.7  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 
346 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  32.98 
 
 
308 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.85 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.46 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.24 
 
 
350 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.85 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 
360 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 
343 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.24 
 
 
367 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.24 
 
 
350 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.24 
 
 
367 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
359 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 
348 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 
360 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.46 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  24.7 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.54 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.92 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.92 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.85 
 
 
343 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.92 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.85 
 
 
343 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.75 
 
 
438 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.68 
 
 
343 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.92 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  31 
 
 
360 aa  86.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  22.97 
 
 
458 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 
362 aa  85.9  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.92 
 
 
351 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.07 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.29 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  25.72 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  27.24 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  25.29 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  29.77 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  22.16 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0145  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550322  normal  0.534197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.31 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  26.88 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  28.37 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  28.37 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  28.37 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  25.14 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  32.41 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  29.3 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  30.19 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>