More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2134 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 308 aa  618  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  68.2 
 
 		 323 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  62.54 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  63.64 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  62.3 
 
 		 311 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  61.04 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  62.71 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  59.09 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  59.42 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  58.44 
 
 		 308 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  59.93 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  59.67 
 
 		 318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  56.03 
 
 		 310 aa  348  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  58.5 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  59.08 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  59.08 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  59.08 
 
 		 309 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  58.69 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  58.09 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  57.52 
 
 		 312 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  55.92 
 
 		 311 aa  341  8e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  57.76 
 
 		 309 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  58.09 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  58.8 
 
 		 309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  59.34 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  60.98 
 
 		 313 aa  334  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  51.3 
 
 		 308 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  58.17 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  52.27 
 
 		 308 aa  318  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  51.49 
 
 		 315 aa  318  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  43.79 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  32.98 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  35.94 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  33.13 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  45.13 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  25 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  32.96 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.5 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  30.95 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  25 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  26.94 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  32.52 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  32.67 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  24.12 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.26 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  32.39 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  36.36 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  34.25 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  36.43 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.61 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07991  putative oxidoreductase  25.44 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.716989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  35.57 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  33.61 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  34.25 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  33.61 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  33.61 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  33.61 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  31.33 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  33.61 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  33.61 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  25.31 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  33.61 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.13 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>