More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0043 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  100 
 
 
309 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  95.47 
 
 
309 aa  583  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  95.15 
 
 
309 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  95.15 
 
 
309 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  92.23 
 
 
309 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  91.59 
 
 
309 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  90.61 
 
 
309 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  81.55 
 
 
309 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  71.99 
 
 
309 aa  447  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  64.69 
 
 
312 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  65.35 
 
 
312 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  57.76 
 
 
308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  57.1 
 
 
308 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  60.4 
 
 
308 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  59.74 
 
 
310 aa  347  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  58.09 
 
 
323 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  58.8 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  58.12 
 
 
318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  54.46 
 
 
308 aa  335  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  55.56 
 
 
341 aa  334  9e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  55.56 
 
 
311 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  55.59 
 
 
311 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  54.61 
 
 
310 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  57.33 
 
 
308 aa  328  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  52.15 
 
 
308 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  52.15 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  48.36 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  52.17 
 
 
311 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  55.74 
 
 
313 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  50.97 
 
 
303 aa  265  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  43.79 
 
 
306 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  27.38 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  27.79 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  26.97 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.36 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  32 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  37.3 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  32.54 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  33.81 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 
367 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 
368 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.35 
 
 
404 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  32.28 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.4 
 
 
353 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  29.56 
 
 
350 aa  63.5  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 
377 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4901  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
350 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  31.75 
 
 
346 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  31.75 
 
 
346 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  31.75 
 
 
346 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  31.75 
 
 
359 aa  62.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  31.75 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  31.75 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.6 
 
 
353 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.6 
 
 
353 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  26.26 
 
 
337 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.4 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  31.75 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  27.17 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  27.17 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
370 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  27.17 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 
355 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  31.75 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 
367 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  25.38 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.6 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  40 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 
370 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  33.33 
 
 
368 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 
351 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  31.75 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  28.77 
 
 
373 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.8 
 
 
353 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 
377 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  29.32 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 
360 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 
360 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>