More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4216 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 309 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  71.99 
 
 		 309 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  72.64 
 
 		 309 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  72.31 
 
 		 309 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  72.64 
 
 		 309 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  71.66 
 
 		 309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  71.66 
 
 		 309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  70.78 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  70.36 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  67.66 
 
 		 312 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  66.89 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  58.31 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  59.93 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  57.65 
 
 		 308 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  58.31 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  59.02 
 
 		 323 aa  354  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  60.53 
 
 		 308 aa  353  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  56.49 
 
 		 311 aa  344  8.999999999999999e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  56.07 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  56.07 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  58.53 
 
 		 310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  55.59 
 
 		 310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  57.61 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  50.49 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  50.98 
 
 		 308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  56.49 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  51.48 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  53.47 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  52.79 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  50.82 
 
 		 303 aa  272  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  41.04 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  33.51 
 
 		 404 aa  72.4  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 		 377 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.28 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  29.08 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  29.08 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  29.08 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  29.08 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  29.08 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  28.57 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  28.57 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  28.57 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  28.57 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  24.45 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  29.08 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  28.57 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  23.96 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  22.81 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.53 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30.14 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  24.84 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  27.27 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  29.53 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.11 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  27.78 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  27.78 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  27.6 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  27.78 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  27.78 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  28.14 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>