More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0941 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  100 
 
 		 311 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  99.68 
 
 		 341 aa  635    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  82.96 
 
 		 311 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  61.17 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  62.3 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  59.02 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  58.69 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  61.59 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  58.9 
 
 		 310 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  59.34 
 
 		 308 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  56.07 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  58.77 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  56.07 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  55.88 
 
 		 309 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  57.1 
 
 		 309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  56.54 
 
 		 309 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  56.11 
 
 		 309 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  56.54 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  56.54 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  52.61 
 
 		 311 aa  334  9e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  55.56 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  56.77 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  52.27 
 
 		 315 aa  332  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  56.11 
 
 		 312 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  56.48 
 
 		 309 aa  328  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  51.77 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  56.13 
 
 		 313 aa  311  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  54.28 
 
 		 303 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  46.56 
 
 		 308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  45.25 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  41.78 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  26.35 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  23.73 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  23.66 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  33.56 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  25.71 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  36.73 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  29.35 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  34.92 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  33.12 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  25.4 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  25.11 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  25.4 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  25.4 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  25.22 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  35.54 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  33.57 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  29.23 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  33.72 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  25.22 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  26.7 
 
 		 404 aa  62.4  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  27.55 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  24.76 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  33.8 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  27.72 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.95 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  32.79 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  35.54 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  35.25 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  32.41 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  32.79 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  32.79 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  32.79 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  26.97 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  35.12 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  24.03 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.18 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  24.03 
 
 		 366 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  27.75 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 340 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.5 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>