More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2597 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  92.31 
 
 		 312 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  67.66 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  65.02 
 
 		 309 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  65.02 
 
 		 309 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  65.79 
 
 		 309 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  65.79 
 
 		 309 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  65.79 
 
 		 309 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  65.35 
 
 		 309 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  64.57 
 
 		 309 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  64.36 
 
 		 309 aa  384  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  58.17 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  60.2 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  57.84 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  56.86 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  57.52 
 
 		 308 aa  355  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  60 
 
 		 310 aa  352  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  59.15 
 
 		 308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  56.44 
 
 		 311 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  60.33 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  56.11 
 
 		 341 aa  340  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  56.11 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  54.13 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  51.32 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  56.39 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  49.84 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  51.14 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  49.84 
 
 		 308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  53.47 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  49.68 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  42.07 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.78 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  34.52 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.78 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.08 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  34.19 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  34.56 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  31.75 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  28.21 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  32.11 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  31.87 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  22.86 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  37.61 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  30.6 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  33.56 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  22.64 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.93 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  28.32 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  25.45 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.9 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.06 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.9 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.9 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.4 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.21 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.97 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.21 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.57 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  25.65 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  26.63 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  26.63 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.68 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  26.59 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.68 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  26.63 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  30.81 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  26.21 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.38 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>